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測序儀

發布時間: 2021-05-13 23:42:19

㈠ 華因康測序儀和solid測序儀有什麼區別

BGISeq-500(內部開發代號Zebra)從命名上就很微妙,看起來直接競爭對手就是illumina 家的NextSeq 500。之前也有兩款國產測序儀,中科紫鑫BIGIS-I和華因康PSTAR-II,在這個貼里我覺得還是不要拿出來被嘲諷以及惡心老東家了。 主要參數: 通量:BGISeq-500: 8-200G,NextSeq 500:25G-120G 讀長:BGISeq-500: 50SE/50PE/100SE/100PE,NextSeq 500:75SE/75PE/150PE 質量:BGISeq-500: Q30 bases > 85%,NextSeq 500:Q30 bases > 75%/80% (嘿嘿) 運行時間:BGISeq-500: ~24h,NextSeq 500:12-30h 可以說是,兩家500全方位正面剛!NextSeq 500的主要目標客戶就是、檢驗所級別的中小型規模應用場景,有別於Hiseq定位於測序工廠,Miseq定位於實驗室高精度快速的科研用途。通量可上可下,可以做人類全基因組測序,也可以做Nifty。從官方數據上看,兩家500各領,各有千秋。

㈡ DNA測序儀

DNA測序儀:
DNA序列測定分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學降解法。自動化測序實際上已成為當今 DNA序列分析的主流。美國pe abi公司已生產出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA測序儀,其中310型是臨床檢測實驗室中使用最多的一種型號。

原理:
abi prism 310型基因分析儀(即dna測序儀),採用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯醯胺平板電泳,應用該公司專利的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,生成的pcr產物則是相差1個鹼基的3''''末端為4種不同熒光染料的單鏈DNA混合物,使得四種熒光染料的測序 pcr產物可在一根毛細管內電泳,從而避免了泳道間遷移率差異的影響,大大提高了測序的精確度。由於分子大小不同,在毛細管電泳中的遷移率也不同,當其通過毛細管讀數窗口段時,激光檢測器窗口中的ccd(charge-coupled device)攝影機檢測器就可對熒光分子逐個進行檢測,激發的熒光經光柵分光,以區分代表不同鹼基信息的不同顏色的熒光,並在ccd攝影機上同步成像,分析軟體可自動將不同熒光轉變為DNA序列,從而達到DNA測序的目的。分析結果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或鹼基排列順序等多種形式輸出。
它是一台能自動灌膠、自動進樣、自動數據收集分析等全自動電腦控制的測定DNA片段的鹼基順序或大小和定量的高檔精密儀器。pe公司還提供凝膠高分子聚合物,包括DNA測序膠(pop 6)和genescan膠(pop 4)。這些凝膠顆粒孔徑均一,避免了配膠條件不一致對測序精度的影響。它主要由毛細管電泳裝置、macintosh電腦、彩色列印機和電泳等附件組成。電腦中則包括資料收集,分析和儀器運行等軟體。它使用最新的ccd攝影機檢測器,使DNA測序縮短至2.5h,pcr片段大小分析和定量分析為 10~40min。
由於該儀器具有DNA測序,pcr片段大小分析和定量分析等功能,因此可進行DNA測序、雜合子分析、單鏈構象多態性分析(sscp)、微衛星序列分析、長片段pcr、rt-pcr(定量pcr)等分析,臨床上可除進行常規DNA測序外,還可進行單核苷酸多態性(snp)分析、基因突變檢測、hla配型、法醫學上的親子和個體鑒定、微生物與病毒的分型與鑒定等。

㈢ 三種高通量測序儀區別 比較

看一下這篇文章,這裡面有著三種平台的比較:
performance comparison of benchtophigh-throughput sequencing platforms
裡面有通量、准確性、數據量、讀長等的比較。

㈣ 基因測序儀的原理

基因測序儀是一種在醫學領域使用的儀器。
原理:

abi prism 310型基因分析儀採用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯醯胺平板電泳,應用該公司專利的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個鹼基的3''''末端為4種不同熒光染料的單鏈dna混合物,使得四種熒光染料的測序 pcr產物可在一根毛細管內電泳,從而避免了泳道間遷移率差異的影響,大大提高了測序的精確度。由於分子大小不同,在毛細管電泳中的遷移率也不同,當其通過毛細管讀數窗口段時,激光檢測器窗口中的ccd(charge-coupled device)攝影機檢測器就可對熒光分子逐個進行檢測,激發的熒光經光柵分光,以區分代表不同鹼基信息的不同顏色的熒光,並在ccd攝影機上同步成像,分析軟體可自動將不同熒光轉變為dna序列,從而達到dna測序的目的。分析結果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或鹼基排列順序等多種形式輸出。

㈤ 能簡單說說測序儀是什麼原理嗎

最日常的Sanger測序是基於類似PCR的反應的,反應體系裡加入一定比例的雙脫氧並帶熒光的ddNTP。反應使用單向引物,從同一個位置起始,如果一個分子在這一步加上的是ddNTP,那它就不會繼續延伸了。這樣產生的一系列不同長度的產物,都帶有停止反應那個位置的鹼基所對應的熒游標記。然後產物拉個單鹼基分辨能力的電泳,每個位置的熒光顏色對應於它的鹼基類型。

㈥ illumina 有哪些測序儀

Illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像Hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次運行的測序量。每張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。Hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。
如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不幹擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

㈦ 第三代基因測序儀在哪裡誕生了

由南方科技大學賀建奎團隊自主研發的第三代基因測序儀在深圳誕生,目前已完成小批量樣機生產,待量產後每個人有望擁有個人專屬的「基因身份證」。

目前,賀建奎團隊已完成第三代基因測序儀和配套試劑的所有研發,並取得包括授權和申請中的專利總數92件以及10餘件海外專利申請。接下來將進入大批量投產階段。

科學技術是突飛猛進,越來越方便人們的生活。

㈧ 現在市面上的基因測序儀 哪個牌子好要是人基因全序列的

現在測序儀占最大頭的是illumina,數據量最大,通量高,准確性也還可以,還有就是roche的454,這個平台讀長長,准確性高,但是數據量小;然後就是life technology的PGM,這個速度快,數據量小,現在新出的Proton數據量會提高到100G,不知道准確性如何;這些平台都是可以測全基因組的!

㈨ 如何評價華大推出的Revolocity測序儀

1. 測序原理依然是CG一直用的Sequencing by ligation (SBL) 而非illumina家明顯占優勢的Sequencing by synthesis (SBS)。 雖然CG在前一段時間買了SBS的專利,但在這款測序儀上明顯沒有使用。28bp的讀長應該是4個7mer連起來的長度。

2. 讀長是28bp。50x coverage一個WGS,每年10000個WGS,一個run跑8天來算的話,一個run的通量大概是32.8T,就數據量講,絕對是測序儀中航母的體量的 #當然佔地面積更是#。准確度按照官方的話說應該是「unbelievable accuracy」,大概錯誤率是1E-6這個級別,顯然是比任何面試的測序儀正確率都遠遠要高。但是請不要忽略了CG這台測序儀的讀長只有28bp,而請考慮把illumina的讀長從250bp和150bp砍到28bp再比較正確率的情況。

3.1 先說優勢。數據產量巨大,因而單位成本一定很低,適合做人類基因組的重測序。CG打從出生就標榜是「人類基因組重測序的最佳測序平台」。28bp的讀長,復雜度低的「人類」基因組(或是外顯子組)處理起來尚且算是得心應手。28bp只能做重測序,組裝什麼的還是擼擼睡吧。而對於NIPT以及類似的技術,測序過程就是「堆砌數據量」,僅需檢測拷貝數變化而不關注覆蓋度和SNP水平的變異,CG這款新機器可能是非常好的選擇(我不是很確定的是,28bp這個長度是否可能對大規模混樣而需要許多復雜度較高的barcode什麼的造成一定的麻煩)。而類似於未來的面向腫瘤無創早起篩查的游離腫瘤細胞(ctC)檢測, 游離腫瘤DNA(ctDNA)檢測,以及面向產前胎兒基因組測序的胎兒有核紅細胞(FNRBC)檢測,所測絕大部分數據將是無用數據,CG這種「數據不要錢」的平台的優勢可能就會顯現。不就是堆數據量么,咱在行。

3.2 劣勢嘛,數據量太大也是一個劣勢——湊不滿run,一般人根本跑不動。參考Hiseq X尷尬的現狀。然後讀長是硬傷,所以除了「人類」「重測序」以外,幾乎沒辦法應用於別的領域了(熊貓那種比人類基因組復雜度還要遠低的大概還是可以啦)。以及28bp對pooling時barcode的影響,表示略擔心。其他的,參考CG以前的機器,其運行穩定性是個考驗,畢竟8天時間不短,反應量數據量都巨大,不知道會不會很容易需要「售後」。

㈩ DNA測序儀已發展到第幾代了什麼時候人們才開始關注DNA測序的國內外的DNA測序儀發展的現狀

測序儀市場在用的,到第三代測序儀。
第一個測序實驗是Sanger於1960s進行,於1976年正式出現第一台商用測序儀。為第一代測序儀;
國內外主流測序儀主要有以下幾種:
第一代測序儀:ABI 的3730XL型號測序儀,測序原理是sanger法測序;
第二代測序儀:illumina的MiSeq、NextSeq、HiSeq等系列型號測序儀;ion torrent的ion Proton測序儀;ABI的SOLID測序儀(已不在中國供貨);羅氏的454測序儀(已於2013年底停產);
第三代測序儀:CG公司的CG測序系統(2013年被華大基因收購,有人認為CG不屬於第三代測序儀);太平洋生物公司的PacBio RSII測序儀等。